ระบบควบคุมการบินและนำทาง S50 ได้รับการออกแบบมาเป็นพิเศษสำหรับ UAV แบบผสม (เครื่องบินปีกคงที่ที่ขึ้นและลงจอดในแนวตั้ง) ซึ่งเหมาะสำหรับเครื่องบินปีกคงที่และควอดโรเตอร์ทั่วไป
ด้วยคอมพิวเตอร์ควบคุมการบินแบบบูรณาการภายในและระบบนำทางแบบไมโครแบบบูรณาการ (GPS/MINS) สามารถทำการขึ้นบินอัตโนมัติด้วยการกดปุ่มเดียว ลงจอด ลอยตัว กลับ ตั้งระดับความสูง เรียกใช้ร่มชูชีพ และฟังก์ชันการล่องเรืออัตโนมัติรูปแบบต่างๆ ตามเส้นทางที่กำหนดไว้
นอกจากนี้ S50 ยังมีฟังก์ชั่นตรวจสอบสถานะการบินและการแจ้งเตือนอย่างครอบคลุม และกลไกการป้องกันเหตุฉุกเฉินที่สมบูรณ์แบบเพื่อให้แน่ใจถึงการทำงานของระบบที่ปลอดภัย
